【終了】2022年度 兵庫県立大学主催 LAMMPS利用セミナー（基礎コース3月16日・応用コース3月17日）オンライン参加も可

2023年2月20日 | Last modified: 2023年8月14日

LAMMPS利用セミナー（オンライン可※要件後述）

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【開催後の事後連絡】

事後連絡について受講者の皆さまへメールにてお知らせしております。ご確認ください。2023/3/17

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基礎コース：LAMMPSの基礎的利用セミナー　3月16日（木） 受講後のアンケートフォーム1

応用コース：LAMMPSのための仮想実験セミナー：　3月17日（金）受講後のアンケートフォーム2

LAMMPS（http://lammps.sandia.gov）は、米国を中心に、高分子物理やソフトマテリアル物理の分子動力学の標準的なソルバーとして位置づけられています。京コンピュータ、スーパーコンピュータ「富岳」やFOCUSスパコンでも企業による利用実績の多いアプリケーションです。分子シミュレーションの重要性拡大を踏まえて、オンライン併用によるデュアル型で開催いたします。LAMMPSを未利用の方は、基礎的利用セミナーからの受講を推奨いたします。なおオンライン受講の方については要件があります。

 

【開催概要】

主  催

共  催

 主催：兵庫県立大学産学連携・研究推進機構 データ計算科学連携センター

 共催：公益財団法人 計算科学振興財団（FOCUS）

高度情報科学技術研究機構（RIST）

兵庫県立大学大学院情報科学研究科
日　時

【日程】   2023年 3月 16日（木） LAMMPSの基礎的利用セミナー

　  2023年 3月 17日（金）LAMMPSでの仮想実験セミナー

【時間】   各日 13:00 ～17:30  (受付 12:45～）　　　　　　　　　　　　　　　　　　
申込締切

  2023年  3月 10日（金）17:00迄 
対象者

  LAMMPSをまだ利用したことがない方、これから活用していきたい方
定　員

 １．会場実習（神戸FOCUS実習室で実施：10名）

 ２．オンライン（実習参加あり）（リモートデスクトップ接続での参加：先着5名）※要件後述「オンライン実習の事前準備」

 ３．オンライン（聴講のみ）（聴講部分への参加のみ。実習は参加せず：20名程度）

 オンライン参加（２、３）には、Zoomクラウド会議システムを使用します。
受講料

  無 料
実習端末

 １．会場実習：実習室に備付のPCを利用します。PCの持参は不要です。

 ２．オンライン（実習参加あり）：各個人のPCを利用します。後述の【オンライン実習の事前準備】が可能か確認をしてください。受講受付後に別途「リモートデスクトップ接続」に関するご案内をお送りします。

 ３．オンライン（聴講のみ）：Zoomが利用可能な端末をご準備ください。
会　場

 高度計算科学研究支援センター（計算科学センタービル）2F 実習室１　アクセス
重   要

 実習参加の受講者は、FOCUS講習会アカウント規定により「本人確認」が必要となります。

 １．会場実習：受付にて「本人確認」を受けてください。

 ２．オンライン（実習参加あり）：必ずビデオカメラ機能をONにし、スタッフによる「本人確認」を受けてください。Zoom表示名はフルネームで表示してください。

 ３．オンライン（聴講のみ）：スタッフによる出席確認にご協力ください。Zoom表示名はフルネームで表示してください。

 

【プログラム】

（内容や講師、時間等は変更する場合がございます。）

  基礎コース  LAMMPSの基礎的利用セミナー（3月16日）

時間 内容 担当講師
12:45～13:00

会場実習　会場受付開始

オンライン実習　Zoom接続開始

・表示名の確認

・ブレイクアウトルーム等の確認

  
13:00～13:05

挨拶

 兵庫県立大学　鷲津  仁志 講師
13:05～13:30

FOCUSスパコン利用準備

・FOCUSスパコンの概要

・FOCUSスパコンへの接続からLAMMPSの実行、VMDでの可視化まで

 FOCUS　坂倉 耕太 講師
13:30～14:30

LAMMPSの入出力の初歩的理解

・LAMMPSの概要

・分子動力学計算の概要

・United Atom 模型による高分子鎖計算

 RIST　富山 栄治 講師
14:30～14:40

休憩

  
14:40～15:40

LAMMPSのexample例の実施

・melt, micelle, colloid

・VMDで可視化する。

・3次元化を試みる練習課題

 RIST　吉澤 香奈子 講師
15:40～15:50

休憩

  
15:50～17:10

LAMMPSを用いたレオロジー計算

・せん断変形下の応力挙動

・せん断変形後の応力緩和

・応力の時間相関関数

 東北大学　村島 隆浩 講師
17:10～17:30 解散・質疑応答  

 

  応用コース　LAMMPSでの仮想実験セミナー（3月17日）

時間 内容 担当講師
12:45～13:00

会場実習　会場受付開始

オンライン実習　Zoom接続開始

・表示名の確認

・ブレイクアウトルーム等の確認

  
13:00～14:00

潤滑膜の分子動力学計算の体験

・潤滑油膜の分子動力学と機構解析

・壁面に挟まれたLJ流体の解析体験

 兵庫県立大学　鷲津 仁志 講師
14:00～14:10

休憩

  
14:10～15:30

LAMMPSの大規模計算体験

・replicateでの大規模化

・スケーラビリティチェック

 RIST　富山 栄治 講師
15:30～15:40

休憩

  
15:40～16:20

LAMMPSを用いたレオロジー計算

・1日目の宿題の確認／データ処理

 東北大学　村島 隆浩 講師
16:20～16:30

休憩

  
16:30～17:10

LAMMPSを中心としたGPUスパコンでの高速高並列計算事例の紹介

 防衛大学　萩田 克美 講師
17:10～17:30 解散・質疑応答  

 

【オンライン実習の事前準備】※

リモートデスクトップ接続でFOCUS実習室の端末に接続していただきます。実習参加予定の端末とネットワーク環境から、「Remoteviewのサイト（ログイン画面）」にアクセスが可能か確認した上で「オンライン実習」をお申込みください。

ネットワークセキュリティー等の理由により「Remoteviewのサイト（ログイン画面）」にアクセスが出来ない等の方は、別途ご相談ください。

「オンライン実習の事前準備」2023年2月27日改訂

【Zoomについて（オンライン聴講＆オンライン実習）】

受講申込の受理後、講習会当日のZoomアドレスなどの情報を、セミナー前日までにメールにてお知らせします。当日は講師やスタッフの指示に従ってください。（Zoomアプリのインストールを推奨）。

Zoom受講環境 推奨モデル（モニター用意など）

【講習会用アカウントの通知について】

セミナー当日に各受講者へ直接お知らせします。

FOCUSスパコン講習会用アカウントの利用について

【資料について】

資料の配布方法は受講者へ別途お知らせします。資料の提供はセミナー参加が必須条件となります。資料のみの提供を要望されてもお受けできませんのであらかじめご了承ください。

【申込方法】

受講ご希望の方は、件名を「受講希望　LAMMPS利用セミナー（会場受講 or オンライン実習 or オンライン聴講）」として以下の枠内のテキストを引用して必要箇所をご記入の上、

講習会窓口 lecture［at］j-focus.or.jp（［at］を@に変更してください）まで送付をお願い致します。

以下のとおり受講申し込みします。

《受講申込セミナー》
受講希望日：
　基礎的利用セミナー（3/16）
　仮想実験セミナー　（3/17）
   （両セミナーの受講を推奨します。仮想実験セミナーのみの参加を希望された場合、FOCUSログイン等の基礎的利用セミナー範囲のサポートはありません）

《いずれかを選択》
１、会場実習（神戸FOCUSにて受講）
２、オンライン（実習参加）
３、オンライン（聴講のみ） 

《受講申込者》
フリガナ：
氏名：
所属機関：
所属部門：
電話番号：
所属機関発行のメールアドレス：（フリーメールアドレス不可※）
※講習会アカウント規定による身分証明を兼ねる為です。

《実習でのFOCUSスパコン利用について》
講習会では各受講者がFOCUSスパコンにログインして実習を行います。※聴講者も規定に準じます。
FOCUSスパコン講習会用アカウント取得にあたり、以下の質問に　yes/no　でご回答ください。

１）FOCUSスパコン利用者です。　yes / no
　「yes」の場合は（課題名：英字３文字）をお答えください。（　　　　　　）

　「no」の場合は以下　２）・３）・４）の質問にお答えください。

２）講習会用アカウントを利用するにあたり、
　「講習会用アカウント利用規程※」を遵守いたします。　　yes / no

３）以下のいずれかにあてはまります。　yes / no
日本人でありかつ日本国に居住するもの
日本人でありかつ日本の在外公館に勤務するもの
外国人でありかつ日本国内にある事務所に勤務するもの
外国人でありかつ日本国に入国後６か月以上を経過しているもの

４）外国法人等や外国政府等の強い影響を受けている者ではありません（以下の特定類型該当者のいずれにも当てはまらないこと） yes / no
外国法人等や外国政府等と雇用契約等を締結している者
外国政府等から年間所得の25％以上の利益を得ている（または得ることを約束している）者
日本での行動に関して外国政府等から具体的な指示や依頼を受けている者

・３）または４）で「no」の場合

講習会窓口 lecture［at］j-focus.or.jp（［at］を@に変更してください）までお問い合わせください。

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【お問合せ先】

講習会窓口 lecture［at］j-focus.or.jp（［at］を@に変更してください）まで、メールにてお問い合わせください。

※参照：「講習会用アカウント利用規程」

FOCUSはこのセミナーについて兵庫県立大学との共同開催を提携の上、事務を受託しております。受講申込に際しては下記個人情報ポリシーに同意したものとみなします。

個人情報利用目的：FOCUS 個人情報保護について