1.FOCUSスパコンの概要 – FOCUSスパコン利用案内

　FOCUSスパコンは平成23年4月より共用を開始し、「産業界向けのスパコン」として活用されています。

　本章では、ハードウェア構成等FOCUSスパコンの概要をまとめております。

1-1 システム概要図

1-2 演算ノード

	ノード数	CPU、GPU、VPU	理論演算性能(GFlops)	コア数	メモリ(GB)	ローカルディスク容量 (GB)	ノード間ネットワーク
Aシステム	208	2.26GHz (Xeon L5640)	108	12	48	500	IB-QDR 40Gbps
Bシステム	2	1.86GHz (Xeon E7520)	119	16	512	1200	IB-QDR 40Gbps
Fシステム	62	2.20GHz (Xeon E5-2698v4)	1152	40	128	2000 (HDD) 64 (SSD)	IB-FDR 56Gbps
Fシステム	（うち2）	Tesla P100 GPU	4.7TF ※3	( -- )	16	2000 (HDD) 64 (SSD)	IB-FDR 56Gbps
Gシステム	4	2.5GHz (Xeon E5-2640)	240	12	64	1000	10GbE
Gシステム	4	Xeon Phi 5110P-1.053GHz	1011 ※1	60 ※2	64	1000	10GbE
Hシステム	136	2.10GHz (Xeon D-1541)	205	8	64	512 (SSD)	10GbE×2 (シャーシ間10GbE×4)
Vシステム	2	VH: 2.40GHz (Xeon Gold 6148)	1024	20	96	240 (SSD)	IB-FDR 56Gbps
Vシステム	2	VE: SX-Aurora TSUBASA Type 10B	2150	8	48	240 (SSD)	IB-FDR 56Gbps
Wシステム	1	VH: 2.40GHz (Xeon Gold 6148)	2048	40	192	240 (SSD)	IB-EDR 100Gbps
Wシステム	1	VE: SX-Aurora TSUBASA Type10B	17203	64	384	240 (SSD)	IB-EDR 100Gbps
Xシステム	6	1.80GHz (A64FX™)	2765	48	32	512 (SSD)	IB-EDR 100Gbps
Zシステム	12	2.10GHz (Xeon Gold 6230)	1408	40	192	2000 (HDD)	IB-FDR 56Gbps
HPCIプリポストシステム	1	2.6GHz (Xeon Silver 4112) Quadro P4000 2基	282	8	1,536	600	-

1-3 システム概要

OS	演算ノード (A,B,G,F,H,Z)	CentOS Linux release 7.9.2009 (Core)
	演算ノード (V,W)	CentOS Linux release 7.7.1908 (Core)
	演算ノード (X)	CentOS Linux release 8.1.1911 (Core) (a64fx)
	共用フロントエンドサーバ ff	Red Hat Enterprise Linux Server release 7.9 (Maipo)
	専用フロントエンドサーバ	CentOS Linux release 7.9.2009 (Core)
開発環境		GCC, Intel Parallel Studio XE （FORTRAN, C, C++等）
ジョブ管理システム		SLURM ベースのシステム（「富岳」と互換）

1-4 共用キュー一覧

計算資源の従量利用は共有キューへジョブを投入してください。

システム	キュー名	最長実行時間	最大同時ジョブ投入数	最大ノード数 (※1)	ジョブあたり最大ノード数 (※1)	ノードあたりコア数	キュー種別	備考
Aシステム	a024h	24時間	400/ユーザ	64	64	12	従量
Aシステム	a168h	168時間	400/ユーザ	32	32	12	従量
Bシステム	b024h	24時間	400/ユーザ	2	2	16	従量
Bシステム	b168h	168時間	400/ユーザ	1	1	16	従量
Fシステム	f024h	24時間	400/ユーザ	60	60	40	従量
Fシステム	f168h	168時間	400/ユーザ	16	16	40	従量
Fシステム	f024h_p100	24時間	400/ユーザ	2	2	40	従量	GPU搭載
Fシステム	f168h_p100	168時間	400/ユーザ	2	2	40	従量	GPU搭載
Hシステム	h024h	24時間	400/ユーザ	136	136	8	従量
Hシステム	h168h	168時間	400/ユーザ	55	55	8	従量
Qシステム	q024h	24時間	400/ユーザ	1	1	64	従量	AMD(64core)
Qシステム	q024h_a100	24時間	400/ユーザ	1	1	64	従量	AMD(64core) + GPU搭載
Rシステム	r024h	24時間	400/ユーザ	10	10	32	従量	AMD(32core)
Rシステム	r168h	168時間	400/ユーザ	5	5	32	従量	AMD(32core)
Vシステム	v024h	24時間	400/ユーザ	2	2	20	従量	VPU搭載
Vシステム	v168h	168時間	400/ユーザ	2	2	20	従量	VPU搭載
Wシステム	w024h	24時間	400/ユーザ	2	2	40	従量	VPU 8基搭載
Xシステム	x024h	24時間	400/ユーザ	6	6	48	従量	Arm(A64fx)機
Zシステム	z024h	24時間	400/ユーザ	20	20	40	従量
Zシステム	z168h	168時間	400/ユーザ	8	8	40	従量
HPCIプリポスト	p168h	168時間	3/ユーザ	1	1	8	無償	無償
Aシステム	a006m	6分	5/ユーザ	2	2	12	無償（デバッグ）	※2
Bシステム	b006m	6分	5/ユーザ	2	2	16	無償（デバッグ）	※2
Fシステム	f006m	6分	5/ユーザ	2	2	40	無償（デバッグ）	※2
Fシステム	f006m_p100	6分	5/ユーザ	2	2	40	無償（デバッグ）	※2, GPU搭載
Hシステム	h006m	6分	5/ユーザ	4	4	8	無償（デバッグ）	※2
Zシステム	z006m	6分	5/ユーザ	4	4	40	無償（デバッグ）	※2, デフォルトキュー

予約状況や混雑状況等により、変更する場合があります。
デバッグキューです。計算資源利用料金は発生しません。デバッグ(ソフトウェアの動作検証等)にご利用ください。なお、FOCUSスパコン従量利用ソフトウェア(Gaussian09等)を実行した場合、計算資源利用料金は発生しませんが、ソフトウェア利用料金は発生します。

実際に本システムを利用する際には、sinfo -s コマンドで利用できるキュー名を確認して下さい。
キューのノード実行状況を確認する際には、squeuesコマンドで確認して下さい。
デフォルトキューは「z006m」となります。ジョブ実行時にキュー名が省略された場合「z006m」で実行されます。
ISVアカウントではデバッグキュー(※2)のみ利用可能です。6分以上の実行が必要となる場合は、ヘルプデスクからご相談ください。

1-5 ストレージシステム

ストレージシステム		NASストレージシステム	分散ファイルシステム	演算ノードローカルディスク※3
マウント先		/home1	/home3	/work
容量		各課題 200GB	要・申請 (※1) (有償)	500GB~6TB （演算システム毎に異なる)
用途		ホーム	ホーム兼ワーク	スクラッチ
書き込み性能	システム全体	500MB/s	11GB/s	80～440MB/s （実測値・演算システム毎に異なる)
書き込み性能	プロセスあたり	（制限なし）	1GB/s	（制限なし）
アクセス	ログインサーバ	○	要・申請 (※1)	×
	共用FE (※2)	○	○	×
	専用FE (※2)	○	○	×
	演算ノード	○	○	○

OKBizより申請してください
FE：フロントエンドサーバ
Hシステムの/work はSSD, そのほかのシステムはHDD

1-6 ソフトウェア

FOCUSスパコンのOS、開発環境、ジョブ管理システム等はアカウント発行料に含む。
商用ソフトウェアは原則利用者がベンダーから直接ライセンスを取得しFOCUSスパコンにインストールして利用。
（FOCUSスパコン上での利用形態、料金、実行方法等はベンダーに直接お問い合わせください。）
Gaussian 09、MIZUHO BioStationはFOCUSがライセンスを取得しており、時間従量制にて利用可。
(要・利用申請（OKBIZ. からご連絡ください)）
オープンソース等で要望が多いものは共用領域にインストール。